Знаменитый нарком сталинского правительства, утверждавший, что его собственный вес не должен превышать шестидесяти килограмм, начинал, как и большинство советских руководителей с подпольной работы, пытаясь, в частности, спасти и под ареста английскими интервентами знаменитых бакинских комиссаров, впрочем, безуспешно. Существует расхожий миф о якобы имевшем место конфликте между Микояном и Нариманом Наримановым из—за вопроса о политическом статусе только что образовавшегося советского Азербайджана. Дело в том, что представители Баку хотели получить статус независимого субъекта международного права и проводить самостоятельную внешнюю политику. На самом же деле, современники, в частности, секретарь одного из бакинских комиссаров Степана Шаумяна, Ольга Шатуновская вспоминает, что конфликт действительно был, и даже было разбирательство на крайкоме ВКП(б), но инцидент оказался столько быстро исчерпан, что даже не фигурирует в документах.
Однако есть и другие мифы, более интересные, распространению которых способствовал сам будущий нарком. Например, Микоян утверждал, что вступил в РСДРП в 1915 году. По свидетельству армянских большевиков, например, Тер—Ваганяна, в упомянутом 1915 год Анастас Иванович был членом боевой организации армянских дашнаков — армянской буржуазно—националистической партии, — чему подтверждением является портрет Микояна в форме маузеристов, напечатанный в газете дашнаков.
Также не имеется достоверных сведений об активном, а, главное, позитивном участии Микояна в освобождении бакинских комиссаров. В советской историографии этот вопрос освещался на основании двух участников событий — Сурена Шаумяна, сына Степана Шаумяна, и Анастаса Микояна. В 1936 году Сурен Шаумян умирает, и единственным свидетелем событий остаётся сам Микоян. Вызывает много вопросов сорвавшийся план эвакуации двадцати шести комиссаров и других бакинских большевиков на пароходе «Сурен«, в частности, грубые нарушения элементарных правил конспирации, обязательных для революционеров. На основании анализа имеющихся в настоящее время документов можно сделать предположение, что Микоян не столько пытался спасти товарищей по партии, сколько устранял неудобных и опасных свидетелей.